Отдел осуществляет следующие полномочия:

• Организация и проведение плановых комиссионных проверок работы должностными лицами Управления и проведение служебных проверок;
• Осуществляет государственную разрешительную функцию по лицензированию фармацевтической деятельности в сфере обращения лекарственных средств ветеринарного применения.
• Организация и проведение обследований предприятий Санкт-Петербурга и Ленинградской области, по заявлению хозяйствующих субъектов, на соответствие требованиям законодательства Российской Федерации в установленной сфере деятельности.
• Организация и проведение контрольно-надзорных мероприятий на территории Санкт-Петербурга и Ленинградской области в соответствии с Федеральным Законом от 26.12.2008 № 294-ФЗ «О защите прав юридических лиц и индивидуальных предпринимателей при осуществлении государственного контроля (надзора) и муниципального контроля».
• Осуществление контроля за исполнением постановлений по делам об административных правонарушениях, вступивших в законную силу и не оплаченных в установленные законодательством Российской Федерации сроки, с применением мер административной ответственности, установленных КоАП РФ.
• Взаимодействие с органами исполнительной власти, осуществляющими принудительное исполнение постановлений по делам об административных правонарушениях.
• Изучение, информирование, консультирование, распространение и пропаганда передового опыта по вопросам охраны труда среди сотрудников Управления, а также осуществление контроля за соблюдением сотрудниками Управления законов Российской Федерации и иных нормативных правовых актов, внутренних распорядительных документов Управления об охране труда.
• Организация и контроль за выполнением мероприятий мобилизационной подготовки в Управлении.

Отдел осуществляет возложенные на него полномочия непосредственно и во взаимодействии со структурными подразделениями Управления, территориальными органами Россельхознадзора, федеральными органами исполнительной власти Санкт-Петербурга и Ленинградской области, органами местного самоуправления, общественными объединениями, другими организациями и гражданами.